Activity 10 / Activité n°10
Title: A new method for precise and reproducible phenotyping of Phytophthora sojae isolates in soybean
Lead Researcher: Richard Bélanger
Research Institution: Université Laval
Titre: Une nouvelle méthode de phénotypage précis et reproductible des isolats de Phytophthora sojae dans le soya
Chercheur principal: Richard Bélanger
Institution de recherche: Université Laval
Description:
This activity proposes the first comprehensive phenotyping of Phytopthora sojae isolates present in Canadian soybean fields based on a novel reproducible bioassay and molecular tools.
Description:
Cette activité propose le premier phénotypage complet d’isolats de Phytophthora sojae présents dans les cultures de soya en sol canadien, fondé sur un nouvel essai biologique fiable et des nouveaux outils moléculaires.
Results / résultats
2020-2021
Title: A new method for precise and reproducible phenotyping of Phytophthora sojae isolates in soybean
Lead Researcher: Richard Bélanger
Research Institution: Université Laval
Titre: Une nouvelle méthode de phénotypage précis et reproductible des isolats de Phytophthora sojae dans le soya
Chercheur principal: Richard Bélanger
Institution de recherche: Université Laval
Description:
This activity proposes the first comprehensive phenotyping of Phytopthora sojae isolates present in Canadian soybean fields based on a novel reproducible bioassay and molecular tools.
Description:
Cette activité propose le premier phénotypage complet d’isolats de Phytophthora sojae présents dans les cultures de soya en sol canadien, fondé sur un nouvel essai biologique fiable et des nouveaux outils moléculaires.
Results / résultats
2020-2021
2020 - Project update video / Vidéo de la mise à jour du projet (disponible seulement en anglais)
2019-2020
2018-2019
- Phenotyping of Saskatchewan, Manitoba, Ontario, Quebec, and Atlantic region isolates was completed
- Molecular/genomic analysis of P. sojae isolates obtained from surveys in Western Canada, ON, QC and Atlantic provinces in 2018 was completed
- Comparative analysis of genotypic and phenotypic data of isolates and alignment of genomic signatures with phenotypes was completed
- Nous avons terminé le phénotypage des isolats provenant de la Saskatchewan, du Manitoba, de l'Ontario, du Québec et de la région de l'Atlantique
- Nous avons terminé l'analyse moléculaire et génomique des isolats de Phytophthora sojae obtenus à partir de relevés effectués dans l'ouest du Canada, l'Ontario, le Québec et les provinces de l'Atlantique en 2018
- Nous avons terminé l'analyse comparative des données génotypiques et phénotypiques des isolats et l'alignement des signatures génomiques avec les phénotypes
2018-2019
- Hydroponic assay was set up at AAFC Brandon and AAFC Morden to identify Phytophthora sojae pathotypes from western Canadian isolates.
- A molecular tool was developed to allow simultaneous diagnosis of the 7 avirulence genes in P. sojae.
- A comprehensive survey of P. sojae presence in soybean fields was conducted (Alberta, Saskatchewan, Manitoba, Ontario, Quebec, and Maritimes). Pathotype identification is ongoing.
- Un essai hydroponique a été mis en place aux stations d’AAC de Brandon et de Morden pour identifier les pathotypes de Phytophthora sojae à partir d'isolats de l'Ouest canadien.
- Un outil moléculaire a été développé pour permettre le diagnostic simultané des 7 gènes d'avirulence chez P. sojae.
- Un relevé complet de la présence de P. sojae dans les champs de soya a été effectué (en Alberta, Saskatchewan, Manitoba, Ontario, au Québec et les Maritimes). L'identification du pathotype est en cours.
Funding for the Soybean Cluster is provided by the Agriculture and Agri-Food Canada AgriScience Program through the Canadian Agricultural Partnership, with industry support from the Canadian Field Crop Research Alliance (CFCRA) whose members include: Atlantic Grains Council; Producteurs de grains du Quebec; Grain Farmers of Ontario; Manitoba Crop Alliance; Manitoba Pulse & Soybean Growers; Saskatchewan Pulse Growers; Prairie Oat Growers Association; SeCan; and FP Genetics.
La grappe du soya est financée par le programme Agri-science d’Agriculture et Agroalimentaire Canada dans le cadre du Partenariat canadien pour l’agriculture. Le soutien de l’industrie est facilité par l’Alliance de recherche sur les cultures commerciales du Canada (ARCCC), dont les membres incluent: Atlantic Grains Council, Producteurs de grains du Québec, Grain Farmers of Ontario, Manitoba Crop Alliance, Manitoba Pulse & Soybean Growers; Saskatchewan Pulse Growers; Prairie Oat Growers Association; SeCan; et FP Genetics.