Canadian Field Crop Research Alliance
  • Overview / Bref survol
    • Board of Directors / Conseil d'administration
  • News / Nouvelles
  • Research / Recherche
    • Current Research / Initiatives de recherche >
      • Soybean Cluster / La Grappe du soya >
        • Activity 2: Short season food type soybean breeding
        • Activity 3: Meeting the soybean protein meal standard in Western Canada
        • Activity 4: Supporting western and northern expansion of soybean in Canada
        • Activity 5: Northern latitude soybean – physiology of yield formation and beating the cold
        • Activity 6: Breeding for Soybean Cyst Nematode (SCN) resistance using marker assisted selection
        • Activity 7: Breeding of high yielding resistance & value-added soybean using elite and exotic germplasm
        • Activity 8: Breeding food grade soybean varieties or germplasm for high yield, better quality or pest resistance
        • Activity 9: Strategies for effective and durable management of Phytophthora and root rot complexes of soybean
        • Activity 10: A new method for precise and reproducible phenotyping of Phythophthora sojae isolates in soybean
        • Activity 11: Ultra early herbicide tolerant soybean
      • Oat Project / Projet Avoine >
        • Activity 1: Breeding, genomics and agronomy research to improve oat yield and quality
      • Corn Project / Projet Maïs >
        • Activity 1: Development of short season, cold tolerant, disease resistant corn inbreds
        • Activity 2: Cross-Canada agronomic and environmental benefit of advanced 4R nitrogen management of grain corn
    • Past Projects / Projets complétés
    • Research Priorities / Priorités de recherche
    • 2016 Research Summit / 2016 ​Sommet de recherche
Activity 10 / Activité n°10

Title: A new method for precise and reproducible phenotyping of Phytophthora sojae isolates in soybean
Lead Researcher: Richard Bélanger
Research Institution: Université Laval

Titre: Une nouvelle méthode de phénotypage précis et reproductible des isolats de Phytophthora sojae dans le soya
Chercheur principal: Richard Bélanger
Institution de recherche: Université Laval



Description:
This activity proposes the first comprehensive phenotyping of Phytopthora sojae isolates present in Canadian soybean fields based on a novel reproducible bioassay and molecular tools.

Description:
Cette activité propose le premier phénotypage complet d’isolats de Phytophthora sojae présents dans les cultures de soya en sol canadien, fondé sur un nouvel essai biologique fiable et des nouveaux outils moléculaires.


Results / résultats

2018-2019
  • Hydroponic assay was set up at AAFC Brandon and AAFC Morden to identify Phytophthora sojae pathotypes from western Canadian isolates.
  • A molecular tool was developed to allow simultaneous diagnosis of the 7 avirulence genes in P. sojae.
  • A comprehensive survey of P. sojae presence in soybean fields was conducted (Alberta, Saskatchewan, Manitoba, Ontario, Quebec, and Maritimes). Pathotype identification is ongoing.

  • Un essai hydroponique a été mis en place aux stations d’AAC de Brandon et de Morden pour identifier les pathotypes de Phytophthora sojae à partir d'isolats de l'Ouest canadien.
  • Un outil moléculaire a été développé pour permettre le diagnostic simultané des 7 gènes d'avirulence chez P. sojae.
  • Un relevé complet de la présence de P. sojae dans les champs de soya a été effectué (en Alberta, Saskatchewan, Manitoba, Ontario, au Québec et les Maritimes). L'identification du pathotype est en cours.
    ​
​2019-2020
  • Phenotyping of Saskatchewan, Manitoba, Ontario, Quebec, and Atlantic region isolates was completed
  • Molecular/genomic analysis of P. sojae isolates obtained from surveys in Western Canada, ON, QC and Atlantic provinces in 2018 was completed
  • Comparative analysis of genotypic and phenotypic data of isolates and alignment of genomic signatures with phenotypes was completed
 
  • Nous avons terminé le phénotypage des isolats provenant de la Saskatchewan, du Manitoba, de l'Ontario, du Québec et de la région de l'Atlantique
  • Nous avons terminé l'analyse moléculaire et génomique des isolats de Phytophthora sojae obtenus à partir de relevés effectués dans l'ouest du Canada, l'Ontario, le Québec et les provinces de l'Atlantique en 2018
  • Nous avons terminé l'analyse comparative des données génotypiques et phénotypiques des isolats et l'alignement des signatures génomiques avec les phénotypes


Funding for the Soybean Cluster is provided by the Agriculture and Agri-Food Canada AgriScience Program through the Canadian Agricultural Partnership, with industry support from the Canadian Field Crop Research Alliance (CFCRA) whose members include: Atlantic Grains Council; Producteurs de grains du Quebec; Grain Farmers of Ontario; Manitoba Crop Alliance; Manitoba Pulse & Soybean Growers; Saskatchewan Pulse Growers; Prairie Oat Growers Association; SeCan; and FP Genetics.

La grappe du soya est financée par le programme Agri-science d’Agriculture et Agroalimentaire Canada dans le cadre du Partenariat canadien pour l’agriculture. Le soutien de l’industrie est facilité par l’Alliance de recherche sur les cultures commerciales du Canada (ARCCC), dont les membres incluent: Atlantic Grains Council, Producteurs de grains du Québec, Grain Farmers of Ontario, Manitoba Crop Alliance, Manitoba Pulse & Soybean Growers; Saskatchewan Pulse Growers; Prairie Oat Growers Association; SeCan; et FP Genetics.
© 2020 - Canadian Field Crop Research Alliance / Alliance de recherche sur les cultures commerciales du Canada